有限(xian)的(de)(de)超算(suan)中(zhong)心和(he)自建計算(suan)集(ji)群的(de)(de)方(fang)式已(yi)無(wu)法滿足超算(suan)用戶計算(suan)業務和(he)創新的(de)(de)需(xu)要(yao)，無(wu)需(xu)排隊的(de)(de)、獨享式的(de)(de)云端(duan)高性能計算(suan)集(ji)群越(yue)來越(yue)受中(zhong)國乃至全球科研人員的(de)(de)青睞，成為(wei)科研創新的(de)(de)一大推動力。
北京某高校藥(yao)(yao)(yao)學(xue)(xue)院藥(yao)(yao)(yao)物(wu)化(hua)學(xue)(xue)課題組(zu)需(xu)要研究和測定氨(an)基酸類藥(yao)(yao)(yao)物(wu)在人體中(zhong)的擴散系數及熱(re)力(li)學(xue)(xue)性質。氨(an)基酸在醫藥(yao)(yao)(yao)上主要用(yong)來制備復方氨(an)基酸輸液(ye)，也(ye)用(yong)作治(zhi)療(liao)藥(yao)(yao)(yao)物(wu)和用(yong)于合成(cheng)多肽藥(yao)(yao)(yao)物(wu)。不(bu)論是使(shi)用(yong)過程(cheng)還是生產過程(cheng)，都涉及藥(yao)(yao)(yao)物(wu)水溶液(ye)的擴散及相關一(yi)些熱(re)力(li)學(xue)(xue)性質的數據。
課題組本地擁有2臺GeForce GTX 1080和1臺NeXtScalenx360 M5。隨著研究課題的深入，模型分子越來越大，這也意味著數據分析和科學超算工作也將成倍增加,本地服務器已無法滿足當前科研算力需求。課題組還咨詢了本校超算中心，但需要等待半個月才有計算資源。
為了不耽誤研究(jiu)進度，團隊對(dui)市面上多家公有云及云超(chao)算平臺進行測試。
綜合效率、成本、易用性和服務等多種因素，最終選擇了北鯤云一站式云超算平臺。
課題組在北鯤云超算平臺啟動1張單卡Nvidia V100使用Amber軟件采用分子動力學手段模擬了1074個氨基酸,共78102個原子在水中的擴散性質，模擬時長5ns，僅需24小時。據悉，在相同體系下，使用本地1張GeForce GTX 1080 GPU卡進行模擬，需要64個小時。使用北鯤云超算平臺，分子動力學模擬提速2倍
北(bei)鯤云(yun)配有獨(du)有的(de)并(bing)行計算調度管理(li)模(mo)塊，可在短短幾分鐘內(nei)快速(su)構建與安裝部署(shu)一個(ge)“獨(du)享(xiang)(xiang)式”的(de)云(yun)端高性能(neng)計算集群(qun)。課題組負責人表(biao)示，“這個(ge)“獨(du)享(xiang)(xiang)式”的(de)集群(qun)，擁有豐富的(de)CPU和GPU資(zi)源、300多個(ge)計算軟件及近百個(ge)生命科學(xue)數據集，能(neng)夠(gou)為(wei)科學(xue)研(yan)究提供穩(wen)定(ding)高效的(de)算力支持和全流程業務服務，從而降低創新(xin)藥物前期研(yan)發的(de)成本(ben)與周期。”
藥(yao)物攸關(guan)國(guo)家(jia)安全,關(guan)乎(hu)人民健(jian)康，北鯤云也將持續(xu)發(fa)揮科(ke)技優勢(shi)，依托(tuo)于(yu)強大(da)的云端(duan)高性能(neng)計(ji)算技術，助(zhu)力科(ke)研(yan)機構的研(yan)發(fa)工作(zuo)提(ti)速(su)，為新(xin)藥(yao)研(yan)發(fa)提(ti)供(gong)強大(da)的技術后盾。
